موفقيت ها و پيشرفت های حوزه‌‌هاى علميه مرهون مجاهدت و تلاش‌‌هاى سلف صالحى است كه به رغم فقدان وسائل و امكانات، تحقيقات و تأليفات ارزنده آنها به عنوان ذخایر علمى گرانبها به دست ما رسيده است، لیكن نيازهاى كنونى جامعه و ضرورت هاى موجود تلاش بيشترى را از دانشمندان و فقه پژوهان امروز در عصرى كه به عنوان عصر فناورى اطلاعات شناخته شده است، مى‌‌طلبد. از این رو پژوهشگران اين عصر باید با احساس مسؤوليت سنگينترى راه گذشتگان را با بهره گيرى از امكانات و شيوه‌‌هاى نوين ادامه داده و به نصرت دين و حفظ و گسترش تراث ارزنده فقه اهل بیت علیهم السلام بپردازند. موسسه علوم تحقیقات علوم اسلامی علامه کلباسی با درک چنین نیاز و ضرورتی، ساختار تحقیقاتی و معاونت پژوهش را ایجاد نموده و با برنامه های گوناگون به اين مهم پرداخته است.
واحد پژوهش موسسه علامه کلباسی با اهتمام آیت الله حاج شیخ احمد کلباسی اشتری همزمان با افتتاح موسسه در این مرکز آغاز به کار کرد و پژوهشهای مختلفی در موضوعات فقهی و اصولی زیر نظر اقای دکتر جندقیان مورد عنایت قرار گرفت که بحمدالله تاکنون منشأ برکات علمی و تحقیقاتی متعددی گردیده است.